MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lysinibacillus sphaericus C3-41 chromosome

Total Repeats: 81739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010382	TGC	2	6	243	248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825619
2	NC_010382	CT	3	6	249	254	0 %	50 %	0 %	50 %	169825619
3	NC_010382	TTC	2	6	292	297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825619
4	NC_010382	AC	3	6	325	330	50 %	0 %	0 %	50 %	169825619
5	NC_010382	ATGC	2	8	334	341	25 %	25 %	25 %	25 %	169825619
6	NC_010382	GGT	2	6	381	386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825619
7	NC_010382	ATC	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825619
8	NC_010382	TTA	2	6	419	424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825619
9	NC_010382	AATA	2	8	460	467	75 %	25 %	0 %	0 %	169825619
10	NC_010382	TGA	2	6	492	497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825619
11	NC_010382	AAG	2	6	530	535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825619
12	NC_010382	CCT	2	6	601	606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825619
13	NC_010382	A	6	6	713	718	100 %	0 %	0 %	0 %	169825620
14	NC_010382	CGT	2	6	816	821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825620
15	NC_010382	AGA	2	6	966	971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825621
16	NC_010382	GAA	2	6	1073	1078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825622
17	NC_010382	TGG	2	6	1081	1086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825622
18	NC_010382	A	6	6	1119	1124	100 %	0 %	0 %	0 %	169825622
19	NC_010382	TCT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825622
20	NC_010382	TTG	2	6	1133	1138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825622
21	NC_010382	CAA	2	6	1157	1162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825622
22	NC_010382	TTA	2	6	1396	1401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825623
23	NC_010382	ATG	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825623
24	NC_010382	AAC	2	6	1440	1445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825623
25	NC_010382	GAA	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825623
26	NC_010382	ACA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825623
27	NC_010382	TTG	2	6	1592	1597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825623
28	NC_010382	CAA	2	6	1637	1642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825623
29	NC_010382	ATG	2	6	1643	1648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825623
30	NC_010382	ATT	2	6	1740	1745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825623
31	NC_010382	CTG	2	6	1781	1786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825623
32	NC_010382	ATT	2	6	1801	1806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825623
33	NC_010382	TAAA	2	8	2000	2007	75 %	25 %	0 %	0 %	169825623
34	NC_010382	TTA	2	6	2042	2047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825623
35	NC_010382	CAG	2	6	2053	2058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825623
36	NC_010382	TAT	2	6	2081	2086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825623
37	NC_010382	TCT	2	6	2087	2092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825623
38	NC_010382	AGA	2	6	2139	2144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825623
39	NC_010382	TTA	2	6	2179	2184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825623
40	NC_010382	TAA	2	6	2226	2231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825623
41	NC_010382	TGT	2	6	2232	2237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825623
42	NC_010382	TCA	2	6	2256	2261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825623
43	NC_010382	TCT	2	6	2275	2280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825623
44	NC_010382	AAG	2	6	2306	2311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825623
45	NC_010382	AGAAGG	2	12	2331	2342	50 %	0 %	50 %	0 %	169825623
46	NC_010382	AT	3	6	2367	2372	50 %	50 %	0 %	0 %	169825623
47	NC_010382	ATTT	2	8	2439	2446	25 %	75 %	0 %	0 %	169825623
48	NC_010382	AATT	2	8	2477	2484	50 %	50 %	0 %	0 %	169825623
49	NC_010382	GTAC	2	8	2491	2498	25 %	25 %	25 %	25 %	169825623
50	NC_010382	GAG	2	6	2638	2643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825624
51	NC_010382	TCA	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825624
52	NC_010382	GAT	2	6	2749	2754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825624
53	NC_010382	ATG	2	6	2885	2890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825625
54	NC_010382	TC	3	6	2906	2911	0 %	50 %	0 %	50 %	169825625
55	NC_010382	TCTA	2	8	2968	2975	25 %	50 %	0 %	25 %	169825625
56	NC_010382	AAC	2	6	3003	3008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825625
57	NC_010382	A	6	6	3068	3073	100 %	0 %	0 %	0 %	169825625
58	NC_010382	AAAG	2	8	3108	3115	75 %	0 %	25 %	0 %	169825625
59	NC_010382	CGT	2	6	3180	3185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825625
60	NC_010382	AGA	2	6	3198	3203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825625
61	NC_010382	TTA	2	6	3292	3297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825625
62	NC_010382	AAC	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825625
63	NC_010382	ATG	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825625
64	NC_010382	AT	3	6	3396	3401	50 %	50 %	0 %	0 %	169825625
65	NC_010382	ATT	2	6	3418	3423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825625
66	NC_010382	GGAA	2	8	3494	3501	50 %	0 %	50 %	0 %	169825625
67	NC_010382	TTC	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825625
68	NC_010382	TGA	2	6	3645	3650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825625
69	NC_010382	ATG	2	6	3674	3679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825625
70	NC_010382	CAG	2	6	3703	3708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825625
71	NC_010382	AATT	2	8	3746	3753	50 %	50 %	0 %	0 %	169825625
72	NC_010382	TAC	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825625
73	NC_010382	GAT	2	6	3790	3795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825625
74	NC_010382	GAT	2	6	3811	3816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825625
75	NC_010382	TTA	2	6	3832	3837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825625
76	NC_010382	TCA	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825625
77	NC_010382	A	6	6	3950	3955	100 %	0 %	0 %	0 %	169825625
78	NC_010382	CAA	2	6	4171	4176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825626
79	NC_010382	ATA	2	6	4216	4221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825626
80	NC_010382	AGAAAA	2	12	4271	4282	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	169825626
81	NC_010382	AGA	2	6	4295	4300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825626
82	NC_010382	CTG	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825626
83	NC_010382	TGG	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825626
84	NC_010382	TGG	3	9	4394	4402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825626
85	NC_010382	GGT	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825626
86	NC_010382	ATT	2	6	4548	4553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825626
87	NC_010382	AAC	3	9	4574	4582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825626
88	NC_010382	ACT	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825626
89	NC_010382	TGA	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825626
90	NC_010382	GAG	2	6	4716	4721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825626
91	NC_010382	GGT	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825626
92	NC_010382	AATC	2	8	4776	4783	50 %	25 %	0 %	25 %	169825626
93	NC_010382	TCT	2	6	4872	4877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825626
94	NC_010382	T	6	6	4882	4887	0 %	100 %	0 %	0 %	169825626
95	NC_010382	TAA	2	6	4895	4900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825626
96	NC_010382	GGT	2	6	4917	4922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825626
97	NC_010382	TTG	2	6	4989	4994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825626
98	NC_010382	AAG	2	6	4996	5001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825626
99	NC_010382	CAAA	2	8	5088	5095	75 %	0 %	0 %	25 %	169825626
100	NC_010382	GTT	2	6	5196	5201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825626
101	NC_010382	GCTCGT	2	12	5220	5231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825626
102	NC_010382	CGT	2	6	5262	5267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825626
103	NC_010382	TTC	2	6	5315	5320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825626
104	NC_010382	TTG	2	6	5350	5355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825626
105	NC_010382	GGA	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825626
106	NC_010382	ATT	2	6	5562	5567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825626
107	NC_010382	TTC	3	9	5619	5627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825626
108	NC_010382	AGGC	2	8	5650	5657	25 %	0 %	50 %	25 %	169825626
109	NC_010382	CCA	2	6	5676	5681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169825626
110	NC_010382	ATG	3	9	5722	5730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825626
111	NC_010382	AAC	2	6	5818	5823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825626
112	NC_010382	TAC	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825626
113	NC_010382	ATT	2	6	5858	5863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825626
114	NC_010382	GAT	2	6	5877	5882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825626
115	NC_010382	TCG	2	6	5936	5941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825626
116	NC_010382	AGA	2	6	6057	6062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825627
117	NC_010382	TCG	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825627
118	NC_010382	CAG	2	6	6188	6193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825627
119	NC_010382	A	6	6	6205	6210	100 %	0 %	0 %	0 %	169825627
120	NC_010382	TTG	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825627
121	NC_010382	TGATGG	2	12	6351	6362	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	169825627
122	NC_010382	ATG	2	6	6461	6466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825627
123	NC_010382	TGC	2	6	6525	6530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825627
124	NC_010382	TCC	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825627
125	NC_010382	ATC	2	6	6646	6651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825627
126	NC_010382	CAT	2	6	6732	6737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825627
127	NC_010382	TACCA	2	10	6803	6812	40 %	20 %	0 %	40 %	169825627
128	NC_010382	A	6	6	6836	6841	100 %	0 %	0 %	0 %	169825627
129	NC_010382	A	7	7	6862	6868	100 %	0 %	0 %	0 %	169825627
130	NC_010382	TGA	2	6	6891	6896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825627
131	NC_010382	CGT	2	6	6904	6909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825627
132	NC_010382	AGT	2	6	6918	6923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825627
133	NC_010382	ACAA	2	8	6974	6981	75 %	0 %	0 %	25 %	169825627
134	NC_010382	ATT	2	6	7070	7075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825627
135	NC_010382	TTA	2	6	7091	7096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825627
136	NC_010382	TCG	3	9	7098	7106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825627
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141	NC_010382	AAG	2	6	7223	7228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825627
142	NC_010382	A	6	6	7325	7330	100 %	0 %	0 %	0 %	169825627
143	NC_010382	TTG	2	6	7403	7408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825627
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147	NC_010382	ATTCT	2	10	7681	7690	20 %	60 %	0 %	20 %	169825627
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159	NC_010382	TGG	2	6	8261	8266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825627
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262	NC_010382	TGG	2	6	25279	25284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825632
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